完顏奴申出身女真策論進士，歷官清要。金哀宗正大三年（1226年）八月，由翰林直學士充益政院說書官。正大五年（1228年）轉吏部侍郎，受命審理近侍張文壽、仁壽、李麟之受敵饋贈之事，發現他們的罪狀。哀宗曲赦諸人之罪，他上書駁回，以快朝論。九月，改任翰林侍講學士，以御史大夫奉使蒙古，在龍駒河（今克魯倫河）朝見窩闊台，十二月還。正大七年（1230年）六月，轉任吏部尚書，再次出使蒙古。天興元年（1232年）春，蒙古軍圍攻南京（今河南開封）數月，完顏奴申奉命前往鄭州海灘寺蒙古軍駐地求和。七月，朝廷以他的功勞拜為參知政事。十月，金哀宗逃到歸德府，以完顏奴申兼樞密副使，與完顏習捏阿不總諸軍留守汴京。天興二年（1233年），汴京西面元帥崔立以城投降蒙古，完顏奴申被殺。