生平

正德八年（1513年）癸酉科應天府鄉試舉人，九年（1514年）聯捷甲戌科二甲第四名進士，授禮部儀制司、祠祭司主事，歷員外郎、主客司郎中，嘉靖元年（1522年）冬出任贛州府知府，三年七月父喪丁憂歸。起復長沙府知府，八年正月赴京入覲，上言時事。調任荊州府，十一年四月上所集刊《大明律讀法》，世宗以其擅自增釋律令，令御史逮問。後改任處州府知府，十六年（1537年）十月升陝西按察司副使，十七年七月升江西布政使司右參政，十八年閏七月被處州府舉人盧綱誣告，被逮捕至京訊問，十九年十一月經過工科左給事中沈良才、刑部署郎中錢衝、錦衣衛千戶魏頤勘查後，証明孫存無罪，遂令複職致仕。後起復升任河南按察使，二十一年閏五月升本省右布政使，二十三年正月以考察調用，二十六年正月考察以不謹閑住。精于刑法，著有《律令讀法》。書法則以清媚見稱。

家族

曾祖孫和。祖父孫允恭，贛州府教授。父孫序（1445年-1524年），字尚禮，自號雙泉居士，成化癸卯舉人，弘治十四年辛酉（1501年）授建寧府推官。生母李氏，贈安人；繼母黎氏，封安人。兄孫孝，益府典膳；孫孜，義官；弟孫季、孫孟、孫厚、孫孚。

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