崔賾七歲就能作文章。長成後身材矮小，有口才。開皇初年，被秦王楊俊推薦，射策及第，隋文帝命他和儒者一起參定禮樂，擔任校書郎。轉任協律郎，被太常卿蘇威看重。母親去世，崔賾去職服喪，五日水米不沾。

召為河南王楊昭、豫章王楊暕侍讀，常常隔日來往于二王宅邸。601年（仁壽元年），楊昭為晉王，崔賾擔任他的屬下記室參軍，離開了楊暕。楊暕和崔賾互通書信，贈給他糧米衣物。晉王府邸的文章多出自崔賾的手筆。605年（大業元年），楊昭為皇太子，崔賾擔任太子齋帥，轉任舍人。606年（大業二年），楊昭去世，崔賾稱病回家。

後隋煬帝召他為起居舍人。608年（大業四年），跟隨煬帝入汾陽宮，宿營河陽鎮。藍田縣令王曇在藍田山撿到一個玉人，奏上。煬帝向群臣諮問玉人的事情，崔賾引用東魏盧元明《嵩高山廟記》，說玉人即神人，表示慶賀，煬帝大喜。崔賾跟隨煬帝登太行山，煬帝問：「什麼地方有羊腸阪」，崔賾回答「《漢書》地理志上說上黨郡壺關縣有羊腸阪」。煬帝說：「不是」，崔賾答：「皇甫謐《地書》上說太原郡北九十里有羊腸阪」。煬帝說：「對」，然後對牛弘說：「崔祖濬就是所謂問一知二的人」。609年（大業五年），崔賾受煬帝之命聚集儒者編纂《區宇圖志》二百五十卷，上奏進獻。煬帝認為不好，又命虞世基、許善心增補六百卷。崔賾父親崔廓去世、崔賾去職守喪。守喪沒有結束，就讓他出來做事。

隋朝遠征高句麗，崔賾任鷹揚長史。高句麗之地設置隋朝郡縣的名字，都是採納崔賾的建議。煬帝命崔賾作《東征記》。613年（大業九年）任越王楊侗長史。山東民眾反隋起事，崔賾受煬帝之命安撫高陽郡、襄國郡，八百多人歸順。616年（大業十二年），跟隨煬帝到江都。618年（大業十四年），宇文化及殺害煬帝，召崔賾為著作郎。崔賾在途中患病，在彭城去世。享年六十九歲。

崔賾和元善、柳䛒、王劭、姚察、諸葛潁、劉焯、劉炫互相友好，休暇的時候終日清談。崔賾所著詞、賦、碑、誌共有十萬言，編纂《洽聞志》7卷、《八代四科志》30卷、未及發表，江都大亂，全成為灰燼。