生平
馮應京生于嘉靖三十四年乙卯（1555年）五月二十一日，八歲其父卒于官，事母至孝。
萬曆十九年辛卯科舉人，二十年（1592年）壬辰科進士，吏部觀政，同年秋以母老請假歸，次年，其母病逝，守喪三年。二十四年（1596年）授戶部主事，督餉薊遼。二十五年朝鮮之役起，調任兵部主事，升職方司員外郎。萬曆二十八年（1600年），任湖廣僉事，整飭武昌兵備，分巡武昌、漢陽、黃州。生性耿直，「不事空言，為淮西人士之冠」。在其《月令廣記》中講「工商皆本」。
後因彈劾稅監陳奉太監事，反遭陳奉控告，萬曆二十九年（1601年）二月湖廣收稅御馬監監丞陳奉彈劾馮應京違抗明旨，阻撓稅務，遂被革職為民。又因科道官員紛紛上疏求情，萬曆帝震怒，令錦衣衛逮送京城，二十九（1601年）年九月二十三日「入囚燕京」，馮應京被逮捕時，百姓「擁檻車號哭，車不得行」。
入鎮撫司獄，拷訊關押，利瑪竇多次去獄中探視，獄中皈依天主教。萬曆三十二年（1604年）九月乙丑（1604年10月10日）發生客星之變，數日後被釋放，棗陽縣令王之翰則死獄中。
應京系獄四年，讀書不輟，勒成《經世實用編》，三十二年甲辰放歸，萬曆三十四（1606年）年正月二十日（新曆2月26日）卒於家，享年五十二歲。天啟二年贈太常寺少卿，吏部錄贈恤諸臣，應京為首，謚曰恭節。
家族
父馮世登官廣東順德訓導。
延伸閱讀
馮應京（1555年 - 1606年），字可大，號慕岡，安徽泗州人。生于鳳陽盱眙縣（今屬江蘇省），萬曆進士，曾任湖廣監察御史，在湖北以「維護風化」為名彈劾泉州思想家李卓吾，又指使歹徒焚毀李卓吾所居之龍湖芝佛院，毀壞李預為藏骨的靈骨塔。後因案入獄，以利瑪竇勸告，歸依天主教。