蕭㪺性情至孝，從兒童時，就翹楚不凡。剛剛長大就擔任府史，與上官言語不合，立即引退，面山讀書三十年。縫製一件皮衣，從半身直拖到腳下，臥時，倚靠著臥榻，誦讀不停片刻，于是博覽群書，天文、地理、律歷、算數，無不研究。侯均說元朝有天下百年，只有蕭惟斗是識字人。學者及其門受業者很多。曾經出門，遇見一婦人，把金釵遺失在在道旁，懷疑蕭惟斗拾了去，對他說：「這裡沒有他人，只有老先生在我後面。」蕭㪺令她跟著自己到門，取家裡的金釵償還。婦人後來找到遺失的金釵，愧謝把蕭㪺的金釵還回了。鄉人有從城中晚間回家的，遇到了賊，賊要加害他，他說「我是蕭先生也」，賊于是驚愕間放走了他。

忽必烈在秦地分籓，以忙哥剌為安西王，徵召蕭㪺與楊恭懿、韓擇侍奉王府，蕭㪺以病推辭，授任陝西儒學提舉，不就任。行省大臣到他家擺宴慶賀，派一個從史先去他家，蕭㪺正在汲水灌園，從史來到，不知道他是為蕭㪺，讓他幫助飲馬，蕭㪺立刻答應，等到穿上冠帶迎賓，從史見到蕭㪺，露出害怕的臉色，蕭㪺不以為意。後官至集賢直學士、國子司業，改任集賢侍讀學士，都沒有就任。大德十一年（1307年），拜為太子右諭德，扶病至京師，入覲東宮，手書《酒誥》進獻，以朝廷當時崇尚飲酒。不久因病力請去職，人問其故，他說：「在禮，東宮太子面向東，師傅面向西，此禮現在可行嗎？」擔任集賢學士、國子祭酒，依然保留右諭德，病發後，堅決推辭後回家。卒年七十八歲，賜謚貞敏。

蕭㪺道德操行高尚，身體力行，其教育他人，必從《小學》開始。做文章，立意精深，言近指遠，以洙、泗（孔子學說）為本，濂（周敦頤）、洛（二程）、考亭（朱熹）為據，關輔的儒士，都推崇他為宗師，稱為一代醇儒。所著有《三禮說》、《小學標題駁論》、《九州志》，及《勤齋文集》，流傳于世。