生平
孔奋年少时跟随刘歆学习《春秋左氏传》，受刘歆称赞，刘歆曾对学生说他在孔奋那学到不少道理。
王莽之乱时，孔奋与其母亲和弟孔奇在河西躲避兵祸。孔家依附在大将军窦融家中，孔奇当年二十一岁，孔奇每次和兄长孔奋议论学问，孔奋都很感谢、佩服孔奇的言论。
建武五年（29年），窦融任命孔奋为议曹掾，代理姑臧县长。建武八年（33年），孔奋受封关内侯。姑臧是河西是最富饶的地方，当时天下尚未平定，许多士人不注重节操，担任县长的，上任还不到几个月就累积大量的财富。孔奋任职四年，清正廉洁，被很多人耻笑，笑其身在脂膏之中却没中饱私囊。
孔奋重视节操，以仁和公平治理地方，太守梁统十分敬重孔奋，不用官属的礼节对待，常到大门迎接，引见给自己的母亲。
陇西和蜀地平定后，河西太守、县令被徵召，官吏财物塞满整车，只有孔奋没有资财，独自一辆车就上路。姑臧的官吏百姓和羌胡都说：「孔君清廉仁贤，全县都受到他的恩惠，如今孔君要离开，我们为何不报答他的恩德！」于是献出牛、马、器物千万以上，追送到数百里。孔奋仅表达感谢，其他东西都并没有接受。抵达京师后，孔奋被任命为武都郡丞。
君鱼保境
时任武都郡丞的孔奋，遭隗嚣馀党隗茂等人攻打府舍，郡守被杀害，贼军担忧孔奋疾行追击，于是捉孔奋的妻子和儿子当作人质。孔奋当时已经五十岁，只有这么一位儿子，但孔奋仍奋力追贼军。官吏和百姓深受孔奋义气而感动，人人加倍卖命和贼军作战。郡里有很多氐人，熟悉山谷地形，有位大豪齐锺留，受氐人敬仰。孔奋命令锺留等人掩护抄击，里应外合、互相配合。贼军穷途末路，便将孔奋的妻儿推往阵前，想藉此让官孔奋军退怯不前，然而孔奋军反而进攻更加猛烈，隗茂等人被擒灭，孔奋妻儿也因此牺牲。汉光武帝下诏嘉奖孔奋，孔奋升任为武都太守。
孔奋认为孔奇博通经典应该要去当官，孔奋则上书以生病的理由辞官，回到家乡后，孔奋以礼法整顿自己的行为，后来孔奋在家中去世。
性格
孔奋为政，能明察是非曲直，做公正的判断，对有美德的人，孔奋对待有如亲人，对行为不检点的人，孔奋对其有如仇人，在武都郡，人们都说他清明公平。
家族
曾祖父
• 孔霸，汉元帝时任侍中。
弟
• 孔奇，作《春秋左氏删》。
子
• 孔某，被隗茂等所杀
• 孔嘉，孔奋晚年生的儿子，官至城门校尉，作《左氏说》。
相关诗词
• 林同：「甘同妻菜茹，极奉母珍羞。一任时人笑，脂膏不自谋。」《孝诗·孔奋》
