1. 序
2. 卷之一　历世圣贤名医姓氏
3. 卷之一
4. 二卷，黄帝著。
5. （二十卷，宋开国公陆佃撰。}}
6. 一卷，四明张尹著。
7. （二卷，唐昝殷撰。}}
8. 二卷，明浙人高士著。
9. 三卷，滑寿撰。
10. 二卷，刘完素撰。
11. 三卷，无求子大观初所著。
12. 一百二十卷。
13. 八卷，元阳赵真人著。
14. 三卷，晋葛洪撰。
15. 三卷，孟诜著。
16. 二十卷，元临川陈自明撰。
17. 二卷，明宗室宁王撰。
18. 四卷，嵩阳寇平衡美集。
19. 四卷，董炳集。
20. 十卷，晋司空张华著。
21. 三十卷，元陶宗仪九成著。
22. 四十卷，浙人楼英全善撰。
23. 一卷，滑伯仁撰。
24. 二卷，宋许希撰。
25. 十卷，浚仪李濂著。
26. 八十卷。
27. 八卷，兴府良医周文采集。
28. 六卷，明刘纯著。
29. 四卷，前人。
30. 二卷，江阴高宾著。
31. 卷之二　内经要旨上
32. 卷之二　内经要旨下
33. 卷之三　翼医通考上
34. 卷之三　翼医通考下
35. 卷之四　内经脉候
36. 卷之五　运气易览
37. 卷之六　经穴发明
38. 卷之七　针灸直指
39. 卷之七
40. 卷之八　中风门
41. 卷之九　伤风门
42. 卷之九　破伤风门
43. 卷之九　厉风门
44. 卷之九
45. 卷之九　〔附〕癜风证
46. 卷之十　风痫门
47. 卷之十一　痹证门
48. 卷之十一
49. 卷之十二　历节风门
50. 卷之十二　〔附〕鹤膝风
51. 卷之十三　伤寒门上
52. 卷之十四　伤寒门下
53. 卷之十四　伤寒补遗
54. 卷之十四　伤寒药方
55. 卷之十五　中寒门
56. 卷之十五　恶寒候
57. 卷之十六　暑证门
58. 卷之十七　湿证门
59. 卷之十七　〔附〕身重证
60. 卷之十八　疸证门
61. 卷之十九　燥证门
62. 卷之二十　火证门
63. 卷之二十一　积热门
64. 卷之二十二　痼冷门
65. 卷之二十三　脾胃门
66. 卷之二十三　倦怠嗜卧门
67. 卷之二十三
68. 卷之二十三　内伤门
69. 卷之二十四　呕吐哕门
70. 卷之二十四　吞酸门
71. 卷之二十四　嘈杂门
72. 卷之二十四　馨气证
73. 卷之二十四　腹中窄狭证
74. 卷之二十四　善悲证
75. 卷之二十四　善太息
76. 卷之二十五　瘟疫门
77. 卷之二十六　郁证门
78. 卷之二十七　咳逆门
79. 卷之二十七　〔附〕梅核气证
80. 卷之二十七　嗝噎门
81. 卷之二十八　翻胃门
82. 卷之二十九　痞满门
83. 卷之三十　胀满门
84. 卷之三十一　水肿门
85. 卷之三十一　〔附〕阴肿门
86. 卷之三十二　蛊证门
87. 卷之三十三　积聚门
88. 卷之三十四　痞块门
89. 卷之三十五　泻泄门
90. 卷之三十六　滞下门
91. 卷之三十七　疟证门
92. 卷之三十八　霍乱门
93. 卷之三十九　证门
94. 卷之三十九
95. 卷之三十九　厥证门
96. 卷之三十九　螈候
97. 卷之三十九　颤振候
98. 卷之四十　痿证门
99. 卷之四十　麻木证
100. 卷之四十一　诸气门
101. 卷之四十二　血证门
102. 卷之四十二　下血
103. 卷之四十三　痰饮门
104. 卷之四十四　咳嗽门
105. 卷之四十四　喘证门
106. 卷之四十五　肺痿证
107. 卷之四十五　肺痈证
108. 卷之四十六　痨瘵门
109. 卷之四十六　声音门
110. 卷之四十七　虚烦门
111. 卷之四十八　虚损门
112. 卷之四十九　癫狂门
113. 卷之四十九　心风门
114. 卷之四十九　邪祟门
115. 卷之四十九　卒中暴死
116. 卷之四十九　飞尸鬼疰
117. 卷之五十　惊悸门
118. 卷之五十　健忘门
119. 卷之五十　恐候
120. 卷之五十　怒候
121. 卷之五十　喜笑不休
122. 卷之五十一　自汗门
123. 卷之五十一　盗汗门
124. 卷之五十二　消渴门
125. 卷之五十三　头痛门
126. 卷之五十三　眩运门
127. 卷之五十四　身体痛
128. 卷之五十四　肩背痛
129. 卷之五十四　拘急候
130. 卷之五十五　皮肤候
131. 卷之五十五
132. 卷之五十五　斑丹火主母门
133. 卷之五十五
134. 卷之五十六　心痛门
135. 卷之五十六　脾痛候
136. 卷之五十六　胃脘痛
137. 卷之五十七　腹痛门
138. 卷之五十七　胁痛门
139. 卷之五十八　腰痛门
140. 卷之五十八　肾著候
141. 卷之五十九　脚气门
142. 卷之六十　疝气门
143. 卷之六十　前阴十证
144. 卷之六十一　眼科
145. 卷之六十一　【附】眉棱骨痛候
146. 卷之六十二　鼻证门
147. 卷之六十二　耳证门
148. 卷之六十三　口病门
149. 卷之六十三　【附】唇病门
150. 卷之六十四　舌证门
151. 卷之六十四　齿候门
152. 卷之六十五　咽喉门
153. 卷之六十六　面部候
154. 卷之六十六　腮候
155. 卷之六十六　髭发门
156. 卷之六十七　瘦瘤候
157. 卷之六十七
158. 卷之六十八　关格候
159. 卷之六十九　秘结候
160. 卷之七十　梦遗精滑门
161. 卷之七十　释梦门
162. 卷之七十　不寐候
163. 卷之七十一　淋证门
164. 卷之七十二　便浊门
165. 卷之七十三　【附】转脬病
166. 卷之七十三
167. 卷之七十四　痔漏门
168. 卷之七十四　脱肛候
169. 卷之七十五　腋气证
170. 卷之七十五
171. 卷之七十六　瘴气门
172. 卷之七十七　中蛊门
173. 卷之七十七　解毒门
174. 卷之七十八　诸虫门
175. 卷之七十九　汤火伤门
176. 卷之七十九
177. 卷之七十九　杖疮门
178. 卷之八十　外科理例上
179. 卷之八十一　外科理例下
180. 卷之八十二
181. 卷之八十二　妇科心镜上
182. 卷之八十三　妇科心镜下
183. 卷之八十四　螽斯广育
184. 卷之八十四
185. 卷之八十四　药方
186. 卷之八十五　胎产须知
187. 卷之八十五　补遗
188. 卷之八十六
189. 卷之八十六　老老馀编上
190. 卷之八十七
191. 卷之八十八　幼幼汇集上
192. 卷之八十九　幼幼汇集中
193. 卷之九十　幼幼汇集下
194. 卷之九十一　痘疹泄秘
195. 卷之九十二　奇病续抄
196. 卷之九十三