生平
崇宁初期，治党事，吕好问以元佑子弟坐废。两监东岳庙，司扬州仪曹。有一次，蔡卞为帅，欲扳附善类，惟吕好问特异他人。吕好问以礼自持，蔡卞不得亲。及蔡卞得政，当时据属拔擢略尽，独吕好问留滞，卞讽之曰：「子少亲我，即阶显列矣。」吕好问笑而不答。
宋钦宗靖康元年（1126年），以荐召为左司谏、谏议大夫，擢升为御史中丞。宋钦宗谕之曰：「卿元佑子孙，朕特用卿，令天下知朕意所向。」先是，徽宗将内禅，诏解党禁，除新法，尽复祖宗之故。而蔡京党戚根据中外，害其事，莫肯行。吕好问说：「时之利害，政之阙失，太上皇诏旨备矣。虽使直言之士抗疏论列，无以过此，愿一一施行之而已。」又说：「陛下宵衣旰食，有求治之意；发号施令，有求治之言。逮今半载，治效逾邈，良田左右前后，不能推广德意，而陛下过于容养。臣恐淳厚之德，变为颓靡，且今不尽革京、贯等所为，太平无由可致。」宋钦宗采纳。
吕好问上疏蔡京过恶，乞役海外，黜朋附之尤者以厉其馀。又建白削王安石王爵，正神宗配飨，褒表江公望，张庭坚、任伯雨、龚夬等，除青苗之令，湔元符上书获谴者，章前后疏十上。每奏对，帝虽当食，辄使毕其说。
不久改为兵部尚书。靖康之难后，金人立张邦昌，以好问为事务官，吕好问劝迎赵构为帝。
建炎元年，高宗即位后，太后遣吕好问奉手书诣行在所，高宗劳之曰：「宗庙获全，卿之力也。」除尚书右丞。丞相李纲以群臣在围城中不能执节，欲悉按其罪。
吕好问也曾替张邦昌说公道话，责问李纲说：「王业艰难，政宜含垢，绳以峻法，惧者众矣。」侍御史王宾论吕好问尝污伪命，不可以立新朝。
宋高宗说：「邦昌僭号之初，好问募人赍白书，具道京师内外之事。金人甫退，又遣人劝进。考其心迹，非他人比。」
吕好问自惭，力求去，且言：「邦昌僭号之时，臣若闭门洁身，实不为难。徒以世被国恩，所以受贤者之责，冒围赍书于陛下。」
疏入，除资政殿学士、知宣州、提举洞霄宫，以恩封东莱郡侯。避地，卒于桂州。
家族
• 曾祖父吕夷简，咸平三年庚子科进士。仁宗天圣七年（1029年），拜相，主持中书省达二十年，庆历三年（1043年），宋仁宗决意改革，罢了吕夷简的宰相兼枢密使职事，任命范仲淹为参知政事。
• 祖父吕公著，北宋大臣，曾任尚书省仆射，兼中书省侍郎，曾为帝师。吕公著与司马光、文彦博、苏东坡、欧阳修，同是王安石变法的反对派。
• 父亲吕希哲，曾任侍讲。
后人
• 子：吕本中、吕揆中、吕弸中、吕用中、吕忱中
• 孙：吕大器
• 曾孙：吕祖谦、吕祖俭
吕好问（1064年 - 1131年），字舜徒，以荫补官，知名理学家，与杨中立并称。有「南有杨中立，北有吕舜徒」之称。南宋初封东莱郡侯，后定居婺州金华（今属浙江）。吕本中是他的长子。