生平
丘處機本名不詳，金熙宗皇統八年戊辰正月十九日（1148年2月10日）生於山東登州棲霞。1166年開始學道。1167年拜全真道祖師王重陽為師，王重陽為他訓名處機，字通密，號長春子。1168至1170年間，丘處機跟隨王重陽在山東和河南傳教。1170年春，王重陽在河南汴梁逝世後，丘處機跟隨同門馬鈺、譚處端和劉處玄到陝西終南山拜會王重陽的朋友，及後於1172年將王重陽遷葬終南山。
1174年為王重陽守喪的期限屆滿後，丘處機先後在陝西寶雞磻溪和隴州龍門山修煉十餘年，自此聲望日隆。1186年冬，他重返終南山主持「祖庭」（今重陽萬壽宮）事務。
金世宗大定二十八年春（1188年），應金世宗的詔書邀請前往燕京會面，受命主持萬春節醮事，留居官庵，期間獲得金世宗三次召見。他在燕京留居半年後，當年秋天得到同意返回的聖旨，1189年春，返回終南山祖庭。
1191年冬，由於金章宗限制全真道在陝西的活動，丘處機被迫帶領部分弟子回到故鄉棲霞。稍後，他將舊宅拓建為太虛觀，繼續弘揚道法。
金哀宗正大四年丁亥七月初九（1227年8月22日），丘處機於金京師大長春宮葆光堂端坐而逝。
掌教時期
1203年劉處玄逝世，丘處機成為全真道第五任掌教。丘處機掌教時間長達二十四年，期間他在政治和社會上積極發揮自己的影響，使全真道的發展進入興盛時期。
金章宗泰和七年（1207年），金章宗和李元妃先後賜額與《玄都寶藏》予棲霞太虛觀。
金衛紹王大安三年（1211年），丘處機奉金衛紹王詔書前往中都，游德興琅山。
在1203至1219年間，他在山東蓬萊、芝陽、掖縣、北海和膠西等地傳教。
金宣宗貞祐二年（1214年），山東登州、寧海州發生農民起義，金朝駙馬都尉僕散安貞請丘處機協助招撫亂民，憑藉丘處機的聲望，登州和萊州等地很快恢復平靜；朝廷賜贈封號「自然應化弘教大師」。
金宣宗貞祐四年（1216年），金宣宗下詔派東平軍王庭玉召丘處機赴汴梁，但丘處機認為金朝皇帝有「不仁之惡」，推辭未前往。
宋寧宗嘉定十二年（1219年）夏天，宋寧宗派遣將領李全、彭義斌持詔書敦請丘處機赴臨安，丘處機認為南宋皇帝有「失政之罪」，也推辭未前往。
成吉思汗的邀請
元太祖十四年（1219年）農曆五月，成吉思汗派使者劉仲祿等人攜帶詔書前往山東邀請丘處機前往蒙古帝國相見，1219年農曆十二月，劉仲祿到達山東萊州昊天觀，奉命邀請丘處機前往蒙古帝國與成吉思汗鐵木真會面，經一再推辭及鐵木真再發言辭真切的詔書後，丘處機在詢問天意後說：「我循天理而行，天使行處無敢違。」遂同意前往。
元太祖十五年（1220年）農曆正月，丘處機挑選門人弟子趙道堅、宋道安、尹志平、李志常等十八名弟子離開山東昊天觀，啟程西去，這時他已經年屆73歲。幾個月後到達大蒙古國統治的燕京（原金朝中都，1215年5月31日被蒙古帝國攻陷後改名燕京），丘處機一行人入駐玉虛觀，得到當地官員的熱情接待。此時，丘處機聽說成吉思汗已經于1219年農曆六月統兵西征中亞的花剌子模沙朝，而自己年事已高倦冒風沙，欲約成吉思汗來燕京會見，于是寫了一份陳情表。劉仲祿乃令曷剌急馳報告成吉思汗。成吉思汗忙于西征戰事，不能東到燕京，便寫了回複詔書，派遣曷剌帶回複丘處機。
丘處機知道燕京會見不可能，便于1221年春天繼續西行。當時劉仲祿欲為成吉思汗挑選處女，丘處機當即勸阻，他說，「春秋時期齊景公為了削弱魯國，派人挑選美女80人送給魯定公。定公與國相季氏朝歡暮樂，朝政日衰，孔子為此指責定公：君相沉溺于聲色，國家何以圖強？」後成吉思汗知悉而罷選。
元太祖十六年（1221年）四月出居庸關，途經漠南和中亞地區，在漠北草原拜會鐵木哥斡赤斤後一路西行，途經鎮海城時接納田鎮海的建議留下宋道安、李志常等九名弟子修建棲霞觀，然後再經回紇城、昌八刺城、阿里馬城、賽藍城。於1221年冬天抵達撒馬爾幹。
元太祖十七年（1222年）四月，丘處機途經鐵門關抵達「大雪山」（今興都庫什山脈）八魯灣行宮覲見成吉思汗，實現了龍馬相會（成吉思汗屬馬，丘處機屬龍）。成吉思汗稱他為「神仙」。同年秋冬，成吉思汗三次召見丘處機，詢問治國和養生的方法，丘處機向他以「敬天愛民」、減少屠殺、清心寡慾等為回應。及後，成吉思汗下詔耶律楚材將這幾次的對話編集成《玄風慶會錄》，全書皆為勸善養生之道。
元太祖十八年（1223年）春天，丘處機向成吉思汗辭行，成吉思汗下詔豁免全真道的賦役，並沿途派兵護送，一行人於冬天抵達宣德府。
跟隨丘處機一路西行的十八名弟子之一的李志常（1193年－1256年，1238年－1256年為全真教掌教），根據一路上的西行見聞，後來寫成《長春真人西遊記》一書，具有重要的史料價值。
晚年
元太祖十九年(1224年)農曆二月初七，丘處機應燕京行中書省尚書石抹鹹得卜的邀請主持天長觀，是時教門大興，當地的道眾組織了「燕京八會」。（平等、長春、靈寶、長生、明真、平安、消災、萬蓮）同年，丘處機持聖旨拯救數萬生靈。《元史·丘處機傳》記載：「此時，國兵踐蹂中原，河南、（河）北尤甚，民罹俘戮無所逃命。處機還燕京，使其徒牒牌招求于戰伐之餘，由是為人奴者得複為良，與瀕死而更生者，毋慮二三萬人，中州人至今稱道之。」自此，全真教盛極一時，丘處機的聲譽亦登峰造極。寺廟改道觀、宗教上信奉佛教更道教者不計其數。
元太祖二十年（1225年）秋天，燕京行中書省宣撫使王楫以「熒惑犯尾」請丘處機作醮祈禳。
元太祖二十一年（1226年）春天，丘處機應邀到薊縣盤山啟建黃籙。1226年夏，燕京大旱，丘處機為百姓設醮祈雨，非常靈驗，很快下雨。
元太祖二十二年農曆五月（1227年），燕京大旱，丘處機為百姓設醮祈雨，天馬上就下雨，被譽作「神仙雨」。
1227年農曆五月二十五日，王志明自秦州前來傳成吉思汗聖旨，聖旨中將天長觀改名長春宮（今北京白雲觀），北宮仙島為萬安宮，並賜「金虎牌」，以「道家事一切仰『神仙』處置」，即詔命丘處機掌管天下道教。詔書中還提到「朕常念神仙，神仙毋忘朕也。」，顯示成吉思汗對丘處機的禮遇極高。
元太祖二十二年農曆七月初九日（1227年8月22日），丘處機在長春宮寶玄堂羽化逝世，享齡80歲。在逝世一周年，他的弟子將他安葬在長春宮內的處順堂。至元六年(1269年)，忽必烈下詔贈封他為「長春演道主教真人」，他去世三天後成吉思汗去世。
今山東嶗山上清宮有丘處機衣冠塚。
作品
• 《磻溪集》
• 《鳴道集》（佚失）
• 《長春真人西遊記》，李志常撰
• 《玄風慶會錄》，耶律楚材記述
• 《大丹直指》，作者存疑（戈國龍主張為施肩吾一系的丹道文獻）
• 《攝生消息論》，作者存疑
評價
正面評價
丘處機對成吉思汗的勸說，稍微減少了蒙古帝國進攻金國時的屠殺和破壞，使他在當時已得到大眾的高度評價，亦使全真道成為當時最興盛的宗教。
後世不少評價，都盛讚丘處機拯救生靈的功德，甚至超越他在宗教上的貢獻。
例如全真道道士撰寫的《金蓮正宗記》便收錄了一個故事，記載三個人在討論丘處機的貢獻，首兩個人分別稱許他的修煉精湛和弘道有功，而最後一人則批評兩者「見其小不見其大」，讚揚丘處機的最大貢獻是使「四百州半獲安生」，倖免於難的百姓「不啻乎百千萬億」。
明代民間戲曲也有一段，正一派道人、茅山派道人與全真派道人相遇，正一道人說他們的法術可以救出地獄中受苦的亡魂，這是道教的精華。茅山道人則說他們可以使信徒清修無礙，死後根本不可能墮入地獄。全真道人則表示，他們的祖師丘長春真人勸服了蒙古可汗，避免了中土遭到蒙古軍的徹底屠殺而變成人間地獄。另外兩人一聽此言，嘆服不已。
又清高宗撰寫一幅對聯，謂「萬古長生，不用餐霞求秘訣；一言止殺，始知濟世有奇功」，都表達了同類的看法，其中「一言止殺」四字成為簡括丘處機貢獻的常用詞。
負面評價
人類學家教授曾經在其作品中聲稱丘處機只是一個貪婪的騙子。
爭議
北京晚報專欄史學研究作家黃逸質疑關於丘處機「一言止殺」一事的說法的正確性，其指出該說法缺乏可靠的文獻來源，而且這一說法有不少錯處。
注釋
丘處機（1148年2月10日 - 1227年），或邱處機，字通密，道號長春子，山東棲霞人，金末元初全真道道士。丘處機為金世宗、金章宗、金衛紹王、金宣宗和元太祖成吉思汗敬重，並因遠赴西域勸說成吉思汗「上至帝王，降及民庶，尊卑雖異，性命各同耳。」而減少屠殺而聞名。在道教史和信仰上，丘處機被奉為全真道「北七真」之一，以及龍門派的祖師。元世祖封號「長春演道主教真人」，元武宗加封「長春全德神化明應真君」。